Réf ABG-129986
ADUM-60671 Sujet de Thèse
26/03/2025
Université de BordeauxLieu de travail
Cestas Cedex – FranceIntitulé du sujet
Utiliser la dynamique énergétique des individus afin d’intégrer les effets cumulatifs des obstacles sur la migration des poissons en rivière // Integrating the cumulative effects of river obstacles on fish migration via individual energy dynamicsChamps scientifiques
- Ecologie, environnement
Mots clés
Poissons migrateurs, Ouvrages hydrauliques, Modèles énergétiques, Télémétrie, Dynamique des Populations
Migratory fish, Hydraulic structures, Energy models, Telemetry, Population dynamics
Description du sujet
Cette thèse a pour objectif de créer des outils méthodologiques qui permettront de prédire l’effet cumulatif sur la dynamique des populations de poissons migrateurs des nombreux obstacles qui jalonnent une vaste majorité de cours d’eau. Si la plupart de ces obstacles sont petits et leur effet sur les poissons a priori faible, leur succession rapprochée durant la migration (un obstacle tous les 4 km en moyenne) peut aboutir à une diminution significative des réserves énergétiques. Rien qu’en France, l’ONEMA, Office National de l’Eau et des Milieux Aquatiques, comptabilisait en 2019 plus de 75 000 seuils et petits barrages parsemant les rivières et cours d’eau de l’ensemble du pays.
Pour estimer l’impact cumulé de ces ouvrages sur la dynamique des populations de poissons, il s’agira dans un premier temps d’intégrer ces coûts dans un modèle qui suit la dynamique de l’énergie au sein des individus (basé sur la théorie du “Dynamic Energy Budget”).
L’effet des obstacles sera introduit dans le modèle énergétique individuel après avoir estimé la dépense énergétique supplémentaire découlant du passage de chaque obstacle en se basant sur les données de télémétrie obtenues au travers de la littérature et directement auprès de porteurs de projets de suivis télémétriques. Des méthodes de changement d’échelle permettront ensuite d’estimer les paramètres démographiques de la population de poissons migrateurs à partir du modèle énergétique individuel.
Ces outils méthodologiques permettront ensuite de répondre à des questions écologiques d’importance et en particulier de comprendre si l’accumulation d’ouvrages hydrauliques même mineurs présente un risque pour les populations de poissons.
L’implication d’acteurs sociaux et économiques, tels que l’OFB et les associations MIGADO et MIGRADOUR, facilitera la conversion des résultats du projet en recommandations pour la gestion des populations de poissons migrateurs et la restauration des cours d’eau.
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The objective of this project is to create tools to predict the cumulative effect of the many obstacles that punctuate a vast majority of rivers on the population dynamics of migratory fish.While most of these obstacles are modest and their effect on fish small, their frequency (one obstacle every 4 km on average) can lead to a significant reduction in energy stores during migration.In France alone, ONEMA, the National Office for Water and Aquatic Environments, counted in 2019 more than 75,000 weirs and small dams along the rivers and watercourses of the country.
The project will assess the cumulative impact of hydraulic structures on the dynamics of fish populations, first by integrating the energy costs incurred for one fish into a model that follows its energy dynamics (based on the “Dynamic Energy Budget” theory). The additional energy expenditure when passing a given obstacle will be estimated using telemetry data obtained from the literature or directly from ongoing tracking projects.Modelling methods will then be applied to the outcome of the individual energy model in order to estimate the demographic parameters of the migratory fish population.
All the methods developed in the project will be applied to important ecological questions, in particular to understand the extent to which the accumulation of small hydraulic obstacles presents a risk for migratory fish populations.Socioeconomic stakeholders, such as the OFB and the MIGADO and MIGRADOUR associations, will be involved in the project from the start in order to facilitate the conversion of the project’s results into recommendations for the management of migratory fish populations and river restoration.
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Début de la thèse : 01/10/2025
Nature du financement
Précisions sur le financement
Contrat doctoral Université de Bordeaux au mérite
Présentation établissement et labo d’accueil
Université de Bordeaux
Etablissement délivrant le doctorat
Université de Bordeaux
Ecole doctorale
304 Sciences et environnements
Profil du candidat
Le candidat recherché devra montrer une grande familiarité avec les approches théoriques, mathématiques et quantitatives de l’écologie (modélisation, statistiques). Une disposition favorable à l’utilisation de l’informatique est nécessaire, à la fois pour implémenter le modèle, regrouper les données de télémétrie en une base de données, et estimer les paramètres du modèle. L’intérêt pour l’écologie des poissons et des cours d’eau est importante, étant donné le focus du projet sur les poissons migrateurs; ainsi que la motivation pour établir des contacts avec les acteurs sociaux intervenant dans la gestion des populations de poissons migrateurs. Le candidat devra montrer sa capacité à coordonner et faire avancer de front plusieurs actions simultanément (construction du modèle, gestion de la base de données, contacts avec les collaborateurs, etc.). Le candidat devra montrer une capacité suffisante pour rédiger et de communiquer en anglais.
The candidate should demonstrate great familiarity with theoretical, mathematical and quantitative approaches to ecology (dynamic modeling, statistics, etc.). Willingness to develop advanced skills in informatics is a necessity in order to implement the model, create a database for telemetry data and estimate the population model parameters. Scientific interest in fish and river ecology is important, given the focus of the project. Motivation to maintain contact with stakeholders involved in the management of migratory fish populations is also important. The candidate will have to show the ability to coordinate and advance several tasks simultaneously (model construction, database management, contacts with collaborators, etc.). The candidate should have a proven capacity to write and communicate in English.Date limite de candidature
28/05/2025
